股权变更程序的办理流程如下：
1、在股权变更后30日内申请变更登记；
2、提交新股东的主体资格证明或者自然人身份证明等规定材料；
3、公司登记机关经审核后办理变更登记。法律依据：《中华人民共和国公司登记管理条例》第三十四条有限责任公司变更股东的，应当自变更之日起30日内申请变更登记，并应当提交新股东的主体资格证明或者自然人身份证明。有限责任公司的自然人股东死亡后，其合法继承人继承股东资格的，公司应当依照前款规定申请变更登记。有限责任公司的股东或者股份有限公司的发起人改变姓名或者名称的，应当自改变姓名或者名称之日起30日内申请变更登记。
