企业购进货物或销售货物发生的运输费用，如果取得运输企业开具的增值税专用发票，可以凭票抵扣进项税额，计算方法都是一样的。
如果是填开在增值税发票上，就用票面上反映的税额进行抵扣。如果有运输发票，用总金额乘7%作为进项进行抵扣，余额进运费或分摊进材料购进成本。
现在运输企业全行业已经实行营业税改增值税了。
在运输业未实行营改增之前，增值税一般纳税人购买和销售货物发生的运费，如取得了运输企业开来的专业发票(普通发票)，可以依据7%的扣除率计算抵扣进项税额。运输业营改增后，这种情况已经不存在了。即7%的扣除率也不存在了。运输业的增值税一般纳税人(年营业额达到500万元以上)，提供运输服务，要按照11%的税率为客户开具增值税专用发票。
