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1、公司基金继承，发生纠纷时，当事人之间可以协商解决，协商不成的，可以起诉到法院，由法院判决。继承人应当本着互谅互让、和睦团结的精神，协商处理继承问题。遗产分割的时间、办法和份额，由继承人协商确定。
2、法律依据：《民法典》第一千一百三十二条，继承人应当本着互谅互让、和睦团结的精神，协商处理继承问题。遗产分割的时间、办法和份额，由继承人协商确定;协商不成的，可以由人民调解委员会调解或者向人民法院提起诉讼。
