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(1)对于“登记和公告”是专利权转让合同的生效条件还是“转让行为”的生效条件，意见不甚统一。一种观点认为登记和公告是专利权转让合同的生效条件，未经登记和公告，该转让合同为无效合同，不具有任何约束力另一种观点则认为根据“合同自由”原则，该转让合同有效，但未经登记和公告，专利权的转让不生效，即该专利权并不发生实际的移转，合同受让方并不能成为新的专利权人。但合同对双方当事人仍有约束力，违约一方应承担违约责任。由于专利法对此规定得不明确，这两种看法均有一定的道理。但是，无论采用哪种观点都可以得出一个结论如果不经过登记和公告，专利权不会发生真正的移转，受让方也不可能真正享有专利权。这一点，专利权转让的当事人(尤其是受让方)应特别予以注意。
(2)由于登记和公告并列成为转让生效的条件，而实践中公告又往往滞后于登记，则在当事人履行了登记手续后，在尚未公告前，仍不能发生专利权的转移。针对这两个问题，经过2000年8月25日第二次修正后的专利法规定：“转让专利申请权或者专利权的，当事人应当订立书面合同，并向国务院专利行政部门登记，由国务院专利行政部门予以公告。专利申请权或者专利权的转让自登记之日起生效”。
