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1、侵犯商业秘密的管辖法院的认定是：
侵犯商业秘密的刑事案件，由犯罪地公安机关立案侦查。必要时，可以由犯罪嫌疑人居住地公安机关立案侦查。
侵犯商业秘密的民事案件，由侵权行为地或者被告住所地中级人民法院管辖。
2、法律依据：
《民事诉讼法》第二十九条
因侵权行为提起的诉讼，由侵权行为地或者被告住所地人民法院管辖。
