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对于需要在当地预缴企业所得税的分支机构，其分配的比例按各分支机构经营收入、职工工资和资产总额占分支机构该三个因素总和的比例进行计算当某公司只有一个分支机构时，则本期企业全部应纳所得税额的50需要在该分支机构缴纳当总机构处在经济特区和上海浦东新区或西部地区等享受税收优惠的地区，其分支机构处在不能享受税收优惠的地区，并且该分支机构没有收入或收入很少时，总机构的收入本来可以享受到税收优惠，但根据汇总纳税管理办法，几乎有50的收入无法享受到税收优惠针对这种情况，企业该如何应对呢?
国税发〔〕28号第十条规定，“总机构设立具有独立生产经营职能部门，且具有独立生产经营职能部门的经营收入、职工工资和资产总额与管理职能部门分开核算的，可将具有独立生产经营职能的部门视同一个分支机构，就地预缴企业所得税。具有独立生产经营职能部门与管理职能部门的经营收入、职工工资和资产总额不能分开核算的，具有独立生产经营职能的部门不得视同一个分支机构，不就地预缴企业所得税。”
不就地分期预缴企业所得税的情形还有以下五种：
1、不具有主体生产经营职能，且在当地不缴纳增值税、营业税的产品售后服务、内部研发、仓储等企业内部辅助性的二级及以下分支机构，不就地预缴企业所得税。
2、上年度认定为小型微利企业的，其分支机构不就地预缴企业所得税。
3、新设立的分支机构，设立当年不就地预缴企业所得税。
4、撤销的分支机构，撤销当年剩余期限内应分摊的企业所得税款由总机构缴入中央国库。
5、企业在中国境外设立的不具有法人资格的营业机构，不就地预缴企业所得税。
所以，可以从二个方面进行考虑：1、当分支机构满足不就地分期预缴企业所得税情形的，分支机构不需要预缴企业所得税，总机构可以充分享受税收优惠2、当分支机构不满足上述在当地预缴企业所得税的条件时，企业可以将总机构的具有独立生产经营职能的部门视同分支机构，参与分支机构预缴比例的计算由于该具有独立生产经营职能的部门与总机构处于同一地区，企业可以最大限度享受到总机构所在地的企业所得税税收优惠。
